После Октябрьской революции 1917 года вернулся на Дон, примкнул к Белому движению. В феврале 1918 года —начальник пулеметной команды бронепоезда. Участвовал в Кубанском Ледяном походе, полковник Донской армии. С 1920 года находился в эмиграции в Югославии и во Франции. В 1939 году выступал в поддержку великого князя Владимира Кирилловича.

В 1942 году приехал в Берлин и по поручению Краснова П. Н. был командирован на Дон по вопросу формирования казачьих коллаборационистских частей для борьбы с Советским Союзом в ходе Второй Мировой войны. С 5 мая 1944 года С. Н. Краснов — начальник штаба Главного управления казачьих войск Имперского министерства восточных оккупированных территорий, произведён в генерал-майоры.

В мае 1945 года сдался англичанам, и в г. Лиенце (Австрия) 28 мая 1945 года вместе с 2,4 тысячами казачьих офицеров был выдан английским командованием советской военной администрации. Был этапирован в Москву, где содержался в Бутырской тюрьме.

Смертный приговор был вынесен на заседании Военной коллегии Верховного суда СССР. Краснов вместе с другими офицерами, за то, что они вели «посредством сформированных ими белогвардейских отрядов вооруженную борьбу против Советского Союза и проводили активную шпионско-диверсионную и террористическую деятельность против СССР» был приговорён к повешению и казнён в Москве 16 января 1947 года.