Обвинялся в том, что в сентябре 1943 года в немецкий офицерский госпиталь в Старо-Титаровской (там был штаб 17-й армии) из станицы Горностаевской доставили 40 детей в возрасте от 6 до 13 лет. У них врачи госпиталя взяли кровь для переливания раненым офицерам. «В результате этого дети погибли и трупы их были выброшены немцами за околицу». Также по приказу Йенеке во время эвакуации 17-й немецкой армии в Крым с Таманского полуострова было насильственно вывезено все трудоспособное население — 106 тысяч человек. В Крыму, по приказам Йенеке, в октябре-ноябре 1943 года и в апреле 1944 года расстреляли всех заключенные концлагерей и тюрем (всего около 6,5 тысяч человек). По приказу Йенеке в ноябре-декабре 1943 года для борьбы с партизанами была создана «мертвая зона» вокруг районов горного Крыма, в полосе от Карасубазара до Бахчисарая общей площадью 800 км². В ходе операции по созданию этой зоны немцы сожгли 30 деревень и расстреляли около 300 жителей, выселили более 2 тысяч человек, разграбив большую часть принадлежащего им имущества. Йенеке также обвиняли в разрушении в ходе эвакуации 17-й армии из Крыма в апреле-мае 1944 года экономических объектов и структур жизнеобеспечения в Севастополе.